Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RTL6Q6ICC9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RTL6Q6ICC9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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