Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AGAP9Q5VTM2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms