Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SP6Q3SY56 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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