Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPHKAPQ2M3C7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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