Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FSCN1Q16658 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms