Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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ZNF56Q15929 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ZNF56Q15929 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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