Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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