Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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