Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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