Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ITGA9Q13797 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms