Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDH18Q13634 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDH18Q13634 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDH18Q13634 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms