Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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