Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LSAMPQ13449 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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