Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSRP1Q08945 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSRP1Q08945 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms