Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms