Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LOXL1Q08397 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms