Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HBBP68871 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HBBP68871 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HBBP68871 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms