Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ERVPABLB-1P60509 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ERVPABLB-1P60509 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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