Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSE1LP55060 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms