Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA2D1P54289 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms