Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC3P51654 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPC3P51654 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPC3P51654 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC3P51654 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPC3P51654 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms