Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETFBP38117 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFBP38117 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFBP38117 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms