Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FDFT1P37268 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FDFT1P37268 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms