Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBP1P32455 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBP1P32455 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms