Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms