Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP1P29466 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms