Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSFA2P28290 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms