Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCM3P25205 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCM3P25205 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCM3P25205 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms