Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRCP23327 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRCP23327 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRCP23327 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms