Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPD1P21695 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPD1P21695 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPD1P21695 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms