Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRAP18433 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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