Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFTRP13569 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms