Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms