Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB3P05106 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB3P05106 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms