Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPAG9O60271 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms