Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM38O00635 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM38O00635 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM38O00635 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM38O00635 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM38O00635 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM38O00635 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM38O00635 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TRIM38O00635 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM38O00635 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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