Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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