Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCAF1Q9Y4C2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms