Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1024Q9UPX6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1024Q9UPX6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms