Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDH22Q9UJ99 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms