Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PEMTQ9UBM1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms