Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms