Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM30AQ9NV96 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms