Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF275Q9NSD4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms