Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIFKQ9BYG3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms