Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C9orf16Q9BUW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C9orf16Q9BUW7 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C9orf16Q9BUW7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C9orf16Q9BUW7 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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C9orf16Q9BUW7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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C9orf16Q9BUW7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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