Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TINF2Q9BSI4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms