Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms