Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT140Q96RY7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms