Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINGO1Q96FE5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms